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使用ggtree实现进化树的可视化和注释

余光创 / 2015-11-30

本文作者：余光创，目前就读于香港大学公共卫生系，开发过多个R/Bioconductor包，包括 ChIPseeker, clusterProfiler, DOSE, ggtree, GOSemSim 和 ReactomePA。进化树看起来和层次聚类很像。有必要解释一下两者的一些区别。层次聚类的侧重点在于分类，把距离近的聚在一起。而进化树的构建可以说也是一个聚类过程，但侧重点在于推测进化关系和进……

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泛滥与缺失：个人征信vs.征信误差评估

王汉生 / 2015-11-04

王汉生@北大光华最近被刺激了！有人被刺激后的反应是以头抢地尔，而教授被刺激的第一反应是：写Paper！故事的发生是这样的。一天组会，大家东拉西扯，也不知怎么就扯到个人征信上去了。于是突发奇想，我请大家把自己的手机掏出来，每个人查一下自己的“芝麻信用”分是多少。王老师的芝麻信用分高居630之多，心想：这么高的芝麻信用分，可以秒杀众多学生，然后可以得意地哈哈大笑。对，就是上面这个样子：哈，哈，哈，……

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统计学发展方向的选择

王汉生 / 2015-10-02

看这题目，多吓唬人。又是方向，又是选择。一看就是知道作者是一个深受商学院教育毒害的砖家！但是，想跟大家说的是，我真心想把这个题目整小点，但是困难。为什么？因为接下来跟大家瞎聊的故事，确实关乎发展方向，确实关乎取舍。或者，至少关乎我自己的研究团队（小二十号兄弟姐妹）的方向和选择！首先给大家简单介绍一点背景知识，小小吐槽一下现在统计学正面临的挑战。先从方法论说起。统计学的方法论主要依赖数学，尤其是概……

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Hadley Wickham：一个改变了R的人

Dan Kopf / 2015-09-21

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王汉生 / 2015-09-13

王汉生@北大光华作为一个在商学院工作了十多年的统计学教员，一天到晚为自己，为学生，或者年轻合作伙伴多写俩Statistical Paper绞尽脑汁，也是无聊透顶，不知道多少脑细胞因此牺牲。难得空闲的时候，就瞎琢磨几个深刻的问题。当然，我也不知道这么深刻的问题，该不该我来琢磨。但是既然琢磨了，就不如写下来跟大家分享探讨。这几个问题就是：中国统计学未来发展的大方向是什么？背后的逻辑是什么？套用一句时……

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我们为什么要做研究？

Terry Speed / 2015-08-31

【COS编辑部按】本文作者是2013年的总理科学奖得主 Terence Terry Speed。关于他的详细介绍，可参考 COS访谈第十二期，Terry Speed教授的名言是“统计学本来就应该成就其他学科，我太爱统计了，它像把钥匙一样让我们能溜进任何学科的后院里随便玩耍”。 […] 原文发表在 IMS Bulletin 链……

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一个数据科学家的这些年

李舰 / 2015-07-20

【COS编辑部按】作者：李舰简介：李舰先生现任堡力山（PMI）集团副总，曾任 Mango Solutions 中国区数据总监。专注于数据科学在行业里的应用。擅长R语言的工程开发与分析建模，是 Rweibo、Rwordseg、tmcn 等 R 包的作者。与肖凯合著了《数据科学中的R语言》，参与翻译了《R语言核心技术手册》、《机器学习与R语言》。李舰先生也曾有多篇文章在统计之都主站上发表。个人主……

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从统计学角度来看深度学习（3）：记忆和核方法

Shakir Mohamed / 2015-06-25

原文链接：http://blog.shakirm.com/2015/04/a-statistical-view-of-deep-learning-iii-memory-and-kernels/ 作者：Shakir Mohamed 连接机器学习的回归方法人们通过对以往的经验或者数据的回忆来推断未来的事物，这样的过程可以用一个经常出现在最近文献中的词语——记忆来概括。机器学习模型都是由这样的‘记忆’……

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从统计学角度来看深度学习（2）：自动编码器和自由能

Shakir Mohamed / 2015-05-24

原文链接：http://blog.shakirm.com/2015/03/a-statistical-view-of-deep-learning-ii-auto-encoders-and-free-energy/ 本文得到了原英文作者Shakir Mohamed的授权同意，由钟琰翻译、何通审校。感谢他们的支持和帮助。基于前馈深度神经网络的判别模型已经在许多工业应用中获得了成功，引发了探寻如何利用……

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数据科学中的“数据智慧”

郁彬 / 2015-05-21

原文链接：http://www.odbms.org/2015/04/data-wisdom-for-data-science/ 本文得到了原英文作者郁彬的授权同意，由吕翔和张心雨翻译、施涛和高涛审校。感谢他们的支持和帮助。在大数据时代，学术界和业界的大量研究都是关于如何以一种可扩展和高效率的方式来对数据进行储存，交换和计算（通过统计方法和算法）。这些研究领域无疑非常重要，然而，只有当我们对数据智……

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Data（动词）

Edward Shepard / 2015-05-12

原文地址：https://medium.com/@blprnt/data-v-da0e0d24777c 作者：Edward Shepard 翻译：腊八粥本文是翻译，版权归原作者所有 […] 让我们把 data 变成动词吧。我 data 你，你 data 我。他们 data 我们，我们 data 他们。当你的简明牛津词典跨过屋子向我飘来时，我们还是花些时间来考虑下面的说法：……

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浅谈医学大数据（中）

陈遵秋 / 2015-03-23

本文作者陈遵秋，美国俄勒冈州，健康科技大学，公共卫生预防系，美国统计协会认证统计分析师；陈漪伊，美国俄勒冈州，健康科技大学，公共卫生预防系，生物统计助理教授（交流微信号：2823095726） […] 医疗大数据有着前面第一节提到的所有特征。在医疗大数据带来各种优势的同时，大数据随之带来的各种特性使得传统的数据处理和数据分析方法及软件捉襟见肘，问题多多。在大数据时代出现之前，受限于数……