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用R语言的blogdown+hugo+netlify+github建博客

钟浩光 / 2018-01-17

用R语言的blogdown + hugo + netlify + github搭建静态博客系统，用rstudio专注于写作。 […] 系统：本文以Windows操作系统为例来介绍安装和配置方法。其他操作系统是类似的。 […] windows下安装很简单，就不描述了。对于git，作为非程序猿的我，一直想学但是一直没学，直到打算用blogdown建个blog玩之后，就注册……

统计图形

ggimage：ggplot2中愉快地使用图片

余光创 / 2017-03-29

作者简介：余光创，香港大学公共卫生学院，生物信息学博士生。博客：https://guangchuangyu.github.io，公众号：biobabble […] 本文介绍了ggimage包，允许在ggplot2作图时嵌入图片，并支持aes映射，可以把离散型变量映射到不同图片。目前有几个包可以使用图片嵌入做图，但都是针对特定的场景，这里使用ggimage来展示在这些特定领域里的应……

统计图形

十行代码看到空气质量指数

郎大为 / 2017-03-15

我错了, 我承认我是标题党, 怎么可能用十行代码完成全国三百个多个城市AQI的抓取, 清洗与可视化呢我仔细数了数, 去掉注释, 一共是9行, 凑个整才是10行耶~ 空气质量指数（Air Quality Index，简称AQI）是定量描述空气质量状况的无量纲指数. 关于空气质量的段子已经层出不穷，连呆在上海的我都已经开始关注北京的天气了: […] 受朋友委托，大家帮个忙：北京人，……

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一款新的 R Markdown 幻灯片制作工具：xaringan

边蓓蕾 / 2017-02-13

今天小编给大家介绍一款新的幻灯片神器：xaringan（中文名：幻灯忍者）。它基于大家都熟悉的 R Markdown 语法，幻灯片中能嵌入 R 代码动态生成输出结果，最后生成的是 HTML5 幻灯片，可以在网页浏览器里打开阅览，我们一起来探个究竟吧。对了，官方教程在这里：https://slides.yihui.name/xaringan/zh-CN.html。在此声明一下本文适宜读者群：R码……

R语言

R与并行计算

赵鹏 / 2016-09-08

作者简介赵鹏，世界知名IT企业性能分析师。在包括多核、分布式以及GPU通用计算方面具有丰富的研究和实践经验，善于帮助客户解决性能问题以及提供并行化方案。R语言爱好者，业余时间创建了ParallelR网站，以此来分享R和并行计算相关内容。 […] 本文首先介绍了并行计算的基本概念，然后简要阐述了R和并行计算的关系。之后作者从R用户的使用角度讨论了隐式和显示两种并行计算模式，并给出了相……

统计图形

可能是目前最好的词云解决方案wordcloud2

郎大为 / 2016-08-10

注：广大的段子手朋友们，下次再用R做词云的时候，记得在wordcloud后面加个2 无论是install.packages(“wordcloud2”) 还是library(wordcloud2) 或者wordcloud2(data) 留下一个无法辩驳的理由，作为一个有情怀的语言，主函数的第一个变量不应该是data.frame么？ […] 最近写了一……

R语言

R语言做符号计算

黄湘云 / 2016-07-08

谈起符号计算，大家首先想到的可能就是大名鼎鼎的Maple，其次是Mathematica，但是他们都是商业软件，除了其自身昂贵的价格外，对于想知道底层，并做一些修改的极客而言，这些操作也很不可能实现。自从遇到R以后，还是果断脱离商业软件的苦海，R做符号计算固然比不上Maple，但是你真的需要Maple这样的软件去做符号计算吗？我们看看R语言的符号计算能做到什么程度。 […] 在R中能够……

统计图形

REmap入门示例

郎大为 / 2016-06-29

REmap是一个基于Echarts2.0 http://echarts.baidu.com/echarts2/的一个R包。主要的目的是为广大数据玩家提供一个简便的，可交互的地图数据可视化工具。目前托管在github，https://github.com/lchiffon/REmap。使用如下步骤安装： library(devtools)……

机器学习

mxnet：结合R与GPU加速深度学习

何通 / 2016-04-07

近年来，深度学习可谓是机器学习方向的明星概念，不同的模型分别在图像处理与自然语言处理等任务中取得了前所未有的好成绩。在实际的应用中，大家除了关心模型的准确度，还常常希望能比较快速地完成模型的训练。一个常用的加速手段便是将模型放在GPU上进行训练。然而由于种种原因，R语言似乎缺少一个能够在GPU上训练深度学习模型的程序包。 DMLC（Distributed (Deep) Machine……

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使用ggtree实现进化树的可视化和注释

余光创 / 2015-11-30

本文作者：余光创，目前就读于香港大学公共卫生系，开发过多个R/Bioconductor包，包括 ChIPseeker, clusterProfiler, DOSE, ggtree, GOSemSim 和 ReactomePA。进化树看起来和层次聚类很像。有必要解释一下两者的一些区别。层次聚类的侧重点在于分类，把距离近的聚在一起。而进化树的构建可以说也是一个聚类过程，但侧重点在于推测进化关系和进……

R语言

COS每周精选：再谈R学习

王小宁 / Ron / 王威廉 / 2015-04-15

本期投稿：王小宁　Ron　王威廉小编注：小编上网看科技新闻，大多数的文章都在讲“大数据”“深度学习”“互联网+”等等高大上的名词，作为一名统计学的研究生小编觉得再高大上的东西，也需要一项或几项核心的技术。近日，小编再为您提供一些R学习的资料。 R语言的优劣势是什么？工欲善其事，必先利其器。应用场景决定知识的储备与工具的选择，反过来，无论你选择了什么样的工具，你一定会努力地把它改造成符合自己应……

机器学习

xgboost: 速度快效果好的boosting模型

何通 / 2015-03-04

本文作者：何通，SupStat Inc(总部在纽约，中国分部为北京数博思达信息科技有限公司）数据科学家，加拿大Simon Fraser University计算机学院研究生，研究兴趣为数据挖掘和生物信息学。主页：https://github.com/hetong007 […] 在数据分析的过程中，我们经常需要对数据建模并做预测。在众多的选择中，randomForest, gbm……